二零零七年，格鲁 一家养猪场出现异常死亡情况，十八年之后竟然由此被证实成为开启全球养猪业的多米诺骨牌，一直持续演变到二零二六年当下，病毒依旧在意大利 野猪群体当中留下全新遗传密码呀，而着手解开这些密码的人正在和时间展开一场赛跑呢。
全球毒株家谱浮出水面
意大利的研究团队，从公共数据库以及本土采样之中，收集到了228条非洲猪瘟病毒全基因组序列，其中有82条是来自意大利在2022年之后的四个疫情集群，借助贝叶斯系统发育动力学模型，他们将这次大流行的病毒家谱进行了重构，结果表明现今在全球肆意流传的基因II型毒株，其共同祖先生活在2005年11月的非洲，95%可信区间跨度是2003年9月至2007年5月，这个时间点比格鲁吉亚首例疫情早了差不多两年，这意味着病毒在“引爆”之前早就已经潜伏。
对于病毒而言，其进化速率经精确测算得出，为每年每位点有1.07×10⁻⁵个替换，基于此换算成全基因组的话，每年大约会产生1.97个突变。尽管这个速率相较于流感等RNA病毒是低的，然而却足以使得研究人员能够如同翻阅历史档案那般，依照时间顺序去排列每个毒株的出现顺序。在东南亚地区，其内部以及跨区域的病毒迁移频次达到了12.2次，几乎处于持平的状态，这揭示了密集的猪肉贸易是以怎样的方式将病毒反复地带入新战场。
腌制火腿成跨洲运输工具
病毒传播版图，因人类活动怎样被改写呢？研究给出了具体数据，病毒在腌制肉制品里能存活137天，这段时间足以令它跨越900公里。体系发育树上长距离跳跃的节点证实，从东欧到西欧的传播事件发生了2.6次，进入东亚的毒株随后反向影响了欧洲本土疫情。意大利坎帕尼亚集群与东亚毒株在MGF 360 - 10L基因位点986处共享一个A→G突变，这条线索指向的或许是某个集装箱、旅客行李或者跨境电商包裹。
非洲猪瘟并非如流感这般借由空气迅速传播，然而它借助了更为高效之交通工具 将自然扩散因素予以剔除后 分析表明病毒于15天内传播之中位距离是94.6公里 最高可信区间能够达到341.8公里 此远远超越了野猪每日几公里之活动半径 唯有卡车 轮船以及飞机方可造就这般跳跃轨迹。
意大利四次疫情三路入侵
二零二二年，于意大利西北部皮埃蒙特地区发觉野猪尸体呈阳性，紧接着其后罗马城区、卡拉布里亚以及坎帕尼亚陆续沦陷。这四簇火苗难道是同源的吗？全基因组测序给出了否定的答案。西北部集群的病毒跟比利时、摩尔多瓦毒株亲缘关系最近，其共同祖先能追溯至二零二一年一月；罗马集群则是与塞尔维亚毒株聚成一支，最近共同祖先在二零二一年七月。两者遗传差异明显，表明是独立传入，并非本土传播链的延续。
卡拉布里亚跟罗马集群尽管有着相同的源头，然而前者带有与众不同的基因缺失情况，这种变异有可能是传入之后才新出现的，又或许意味着存在未被采样的中间宿主给予暗示。最让研究者提心吊胆的是坎帕尼亚集群，它越过了整个东欧区域，直接在进化树上和东亚毒株关联在一起。单基因分析证实了这个结论，MGF 360 - 10L的特异突变变成了指认病毒源头的遗传指纹。
监测网络存在明显盲区
有关意大利大陆的至少三次独立传入情况，这意味着病毒在两年的时间里至少三次避开了边境检疫以及早期预警系统。西北部集群于2022年1月出现，然而回溯分析表明其祖先早在2021年初便已然存在，入侵时间跟检出时间之间存在着数月的空白。罗马城区集群则径直进入人口密集的首都圈，野猪与城市边缘地带的接触带来了独特的防控难题。
坎帕尼亚的毒株带有东亚特征突变，此传播链经过的地理尺度极大，然而却没有在中途被拦截，研究团队表明，现有的监测体系对于猪肉制品里存活病毒的警觉性欠缺，口岸抽检的样本数量以及检测方式需要再次评估，每一个未被发觉的携带者，都有可能成为点燃新疫区的火星。
腌制时长暴露防控软肋
病毒存活期为137天，这对应的是意大利传统猪肉腌制工艺的标准时长，帕尔玛火腿、圣丹尼火腿等地理标志产品的法定腌制期从几个月到一年不等，这些产品恰恰有可能通过冷链、行李或邮寄渠道流动，研究证实病毒在盐腌、风干后的猪肉中仍具感染性，而当前贸易检疫的病毒检测窗口期往往集中在活猪和鲜肉上。
一个东欧疫区农场的猪肉制品，因有着900公里的传播半径，所以能够轻易抵达西欧的任何一个城市。疫情期间，多国曾针对野猪活动范围设置围栏，然而病毒还是跨越海洋登陆撒丁岛，并且越过阿尔卑斯山进入法国。物理屏障无法阻挡贸易路线，这便是分子溯源技术必须嵌入防控决策的根本缘由。
精准溯源需要数据拼图
全长约17万碱基的非洲猪瘟病毒基因组，每年产生不到两个突变，由此给精确追踪造成挑战。此次研究借助多重序列比对以及布朗运动随机游走模型，针对日期不明确的样本展开时间校准，还要对内部节点落点在非疫区的支系实施算法修正，如此才获取清晰的传播地图。即便这样，意大利却仍有部分传播节点的地理来源无法判定，这提示公共数据库的毒株覆盖度那儿存在空白区。
结论十分明确，是研究团队于《Virus Evolution》发表的：仅靠扑杀以及生物安全升级，并不足以阻断输入，还得将病毒系统发育分析，与贸易流向、野猪生态、入境检疫数据相叠加。欧洲食品安全局已于2025年底，启动了类似的数据整合平合，意大利四个集群的基因序列，会成为该平台首批入库样本。
望着意大利地图之上那四个彼此之间并不相连的、呈现为红色点状之物，你是否的的确确会对此产生好奇呢：那一架运载着坎帕尼亚毒株的航班，到底是从东亚地区的哪一个机场起飞升空的呀？热忱欢迎在评论区域之中写下你个人的推测，一块儿跟随追踪这个跨越了欧亚大陆的如同间谍一般的病毒呢。
